侧翼序列是指染色体上特定位置点两侧的DNA序列，包含候选基因、转录调控、染色体结构、生物安全等信息。它在基因组学研究中发挥着重要作用。侧翼序列获取技术主要用于启动子和增强子等调控序列的克隆、T-DNA或转座子插入位点的鉴定、染色体步移、全基因组缺口填补等，是结构基因组研究和功能基因组研究的重要手段，在转基因动植物的鉴定和安全管理中有重要应用。随着分子生物学的发展，已经建立了许多获得侧翼序列的方法。根据技术原理可分为五类：质粒拯救法、反向PCR法法、外源性联合介导PCR法法、半随机引物PCR法和基因组重测序法。本文系统总结了近年来侧翼序列采集技术的研究进展，系统总结了这些技术的原理和应用，为侧翼序列信息的采集提供参考。