为了筛选能有效控制烟草根结线虫的微生物菌剂，在烟草田应用了三种不同的高山微生物制剂（B3蜡样芽孢杆菌、B9蜡样芽孢杆菌和S2蕈状芽孢杆菌）。采用宏基因组测序技术分析了不同芽孢杆菌对烟草根际土壤细菌群落的影响及其对根结线虫的控制效果。结果表明，芽孢杆菌可以增加土壤中的细菌数量，其中B3蜡样芽孢杆菌土壤中的细菌数量最高。与使用清洁水（对照）相比，B3蜡样芽孢杆菌可以增加有益菌门硝化螺旋菌门（Nitrospirae）、有益菌属贪噬菌属（Variovorax）和罗思河芽孢杆菌（Rhodanobacter）的丰度，B9蜡样芽孢杆菌可以增加有益菌-亚硝化螺菌属（Nitrosospira）的丰度，S2-蕈状芽孢杆菌可以增加有益菌-红假单胞菌属（Rhodo，pseudomonas）中慢生根瘤菌属（Mesorhizobium）的丰度。假单胞菌科（Pseudomonadaceae）有利于控制根结线虫，其在B3蜡样芽孢杆菌处理中的丰度显著高于对照。三座芽孢杆菌对烟草病害有一定的防治效果，但B3蜡样芽孢杆菌的效果最好。