为了探索Tc1/mariner转座子超家族对褶皱臂尾轮虫（brachion us　plicatilis）和基因表达调控基因组结构的影响，本研究基于褶皱臂尾轮虫的基因组和转录组数据，注释了褶皱臂尾轮虫的重复序列，并统计和丰富了转座子和相邻基因在褶皱臂尾轮虫的表达，10个转座子家庭（其中3个属于Tc1／Mariner超家族）在该基因的上游、下游和内部区域富集。在对褶皱臂尾轮虫Tc1/mariner超家族的分析中，发现了七个亚家族：Tc1（DD34E）、Tc2（dd35d）、Mariner（DD34D）、Pogo（DDxD）、Sagan（DD30D）、Tigger（DD32/36d）和Fot1（DD30D），它们主要分布在基因间区域，转座酶催化区的结构和系统发育分析表明，具有完全转座酶的三个亚家族（Tc1、Tc2和Pogo）高度保守，聚类良好。根据转录组数据，发现每个家族的表达模式相似，在雄性阶段表达更高。Tc1／Mariner超家族邻近基因的功能涉及大量环境信息处理和生物发育调控，反映了褶皱臂尾轮虫基因组对环境的适应。通过系统分析褶皱臂尾轮虫Tc1／Mariner转座子超家族在基因组中的进化和表达，本研究为从功能角度理解Tc1/mariner 转座子，以及理解Tc1/mariner在基因组进化中的作用提供了新线索。