基于数据非依赖采集的蛋白质组质谱数据解析方法研究进展
作者:侯鑫行; 周丕宇; 宫鹏云; 付嘉乐; 刘超; 王海鹏
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数据独立采集(DIA)是近年来在高山地区迅速发展起来的一种质谱采集技术。理论上,通过在无偏碎片隔离窗口中采集所有母体离子的二次光谱,可以实现蛋白质样品的深度覆盖。同时,它具有高通量、高重现性和高灵敏度的优点。现有的DIA数据采集方法可分为全窗口分段法、隔离窗口序列分段法和四维DIA数据采集方法(4DDIA)。根据DIA数据的不同特点,主要的数据分析方法有谱库搜索法、蛋白质序列库直接搜索法、伪二次谱识别法和从头测序法。需要评估从分析中获得的肽段识别结果的可靠性,它包括两个步骤:重新排序机器学习方法和估计报告结果集的可信度,以实现数据分析结果的质量控制。本文对评估结果的数据收集方法、数据分析方法、软件和可靠性评估方法进行了整理和总结,并展望了未来的发展方向