目的探讨甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶治疗弥漫毒性甲状腺肿（Graves病）合并桥本甲亢的疗效及其对甲状腺过氧化物酶抗体（TPO抗体）、甲状腺球蛋白抗体抗体（TgAb抗体）和促甲状腺素受体抗体（TRAb抗体）的影响。方法选择2018年9月至2019年8月在肇庆市第一人民医院内分泌诊所接受治疗的98例Graves病合并桥本甲亢患者为研究对象。随机数字表法分为观察组（49例）和对照组（49例）。观察组用甲巯咪唑进行治疗，对照组用丙硫氧嘧啶进行治疗。观察临床疗效、TPOAB指数、TgAb指数和TRAb指数的变化以及不良反应的总发生率。结果两组治疗后TPOAB、TgAB、TRAb、游离三碘甲状腺原氨酸（FT3）和游离甲状腺激素（FT4）水平均低于治疗前，高代谢症状和促甲状腺激素（TSH）的缓解率均高于治疗前。观察组TPOAB、TgAB、TRAb、FT3和FT4的水平均低于对照组，同时TSH的水平也显著高于对照组（P<0.05）。观察组不良反应总发生率低于对照组（P<0.05）。结论对于Graves病的桥本甲亢，丙硫氧嘧啶和甲巯咪唑可以发挥更好的治疗效果。其中，甲巯咪唑的疗效优于丙基硫氧嘧啶，不良反应少，安全性高。值得临床广泛推广。