CHEK2基因SNP位点在三阴性乳腺癌中的突变分析研究
作者:柯龙珠; 唐东昕; 冷福玉; 陈杰; 刘杰; 罗莉
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目的观察单核苷酸多态性(SNP)在三阴性乳腺癌(TNBC)CHEK2基因功能区的突变情况。方法选择2017年12月至2020年1月贵航贵阳医院和贵州中医药大学第一附属医院门诊和住院的40例TNBC患者的病理组织蜡。在TNBC相关性检测到CHEK2基因的24个SNP位点。石蜡DNA提取试剂盒用于提取病理组织蜡的DNA,并进行甲基化。使用引物设计软件pyro mark assign design 2.0设计引物序列。在聚合酶链反应扩增后,通过焦磷酸测序检测法检测CHEK2基因功能区的候选SNP位点,并分析SNP位点的突变。最后,使用来自焦磷酸测序仪的pyro q-aq软件自动分析每个站点的基本比率。结果在40例TNBC患者的Aristole 2基因中检测到24个SNP位点。其中,D82A和E79G位点序列具有重复结构,未设计合格的引物。结果显示,K131n、k142e、P152S和T366FS是突变频率和T366FS的四大地点。其中,K131、K142E和P152S属于叉头地区,而T366FS属于叉头地区。没有突变的位点是T59K、I157T、1100del C、E394K、Y424C和R475FS。R145W位点的大部分样本均未发生突变,部分样本有明显突变,而其他位点的突变率较低。结论TNBC患者的四个较高位点分别为K131n、k142e、P152S和T366FS。