[目的]探索新转录本肉牛（Bos　taurus）及其潜在功能，为进一步探索牛肉品质差异的遗传机制提供思路方法]以平凉红牛、杂交牛（和牛平凉红牛）和西门塔尔牛为研究对象，采集背最长肌，用RNA-SEQ测序构建cDNA文库。将重组后的测序数据与牛参考基因组序列进行比较，以优化注释转录本的信息，挖掘新的转录本并分析其功能富集。为RT-qPCR验证结果，随机选择了9个显著差异表达的新转录本]分别扩展了1081个转录本的5’未翻译区（UTR）和1586个转录本的3’UTR，以及1038个转录本的5’和3’UTR。在发掘出的442个新转录本中，92个新转录本在不同种群中的表达存在显著差异（P<0.05）。GO分析表明，表达差异显著的新转录本在代谢过程、酶催化活性和细胞部分都显著富集。KEGG富集研究发现，表达差异显著的新转录本在味觉传导、过氧化物酶河马（Hippo）和MAPK显著富集。RTqPCR研究结果与RNA-SEQ研究结果在数量上存在差异，但变化趋势是一致的，表明转录组测序的结果是可靠的结论]新转录本广泛参与调节各种生命活动，如肌肉生长、脂肪沉积、疾病和免疫，通过各种代谢途径和途径。