肝癌细胞周期调控相关基因预后模型构建与评估

作者:孙东旭; 朱文静; 金志朋; 刘华元; 朱朋程; 史光军
更新时间:

目的构建基于细胞周期调控相关基因的肝癌预后模型,为肝癌的预后预测和肿瘤治疗提供新的思路和方向。方法从TCGA肿瘤数据库、GEO基因表达数据库和ICGC肿瘤基因数据库收集肝癌患者的mRNA表达谱和临床数据。R软件 analysis对肝癌的差异表达基因进行了筛选,并通过pathway and gene function enrichment(PPEA)确定了与细胞周期相关的基因集。采用单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier曲线确定与肝癌预后相关的细胞周期调控基因,并用Lasso Cox回归模型构建和验证肝癌预后模型。最后,对三对临床样本进行测序,以验证基因表达水平。结果通过差异筛选、基因富集分析和单因素Cox回归分析,发现24个细胞周期调控基因与肝癌患者的预后有关(HR>1,FDR<0.05)。Lasso-Cox回归构建的肝癌预后模型的评估结果显示,高危组的总生存时间(OS)显著低于低危组(TCGA-LIHC构建队列P<0.001,LIRI-JP验证队列P<0.001)。风险评分是OS的独立预后因素(HR>1,P<0.001)。临床样本测序结果显示,大多数受肝癌细胞周期调控的预后基因在肝癌组织中显著高表达。结论本研究构建了具有细胞周期调控相关基因的肝癌患者预后模型,为肝癌患者的预后预测和治疗提供了新思路和分子治疗靶点。