驴奶是一种新型特种奶。由于其营养成分接近母乳，因此越来越受到人们的关注。然而，与世界其他国家相比，我国对驴奶的研究起步较晚，尤其是对代谢组学和我国不同主要产区驴奶脂肪组学的比较研究鲜有报道。因此，本文采用无创和脂质组学技术对国新疆和山东产驴奶中的代谢物和脂质进行了比较研究。通过对驴乳中代谢物和脂类的差异和比较分析，在正离子和负离子模式下分别筛选出46种不同代谢物和86种不同脂类。其中，差异代谢物包括重要的化合物，如吗啡感受素（Morphiceptin）、麦冬皂苷（马德隆吉赛德C）和戊基羟脯氨酸（谷氨酰羟脯氨酸）。进一步分析发现，这些化合物分别与蛋白水解和微生物代谢有重要关系。本研究发现的差异可以作为潜在的标记物，为驴奶的产地鉴别提供一定的参考依据，为驴奶的进一步加工提供理论依据。