环境内分泌干扰物对子宫内膜异位症影响的生物信息学分析

作者:李楠; 陈蕾; 张琨
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目的通过生物信息学分析,探讨环境内分泌干扰物(EDC)对子宫内膜异位症(EMS)的潜在影响。方法 在毒理基因组学数据库(CTD)中分别搜索了双酚A(BPA)、四氯二苯并对二恶英(TCDD)和邻苯二甲酸二苯酯(DEHP),在其相关疾病中发现了“子宫内膜异位症”,下载了相关的基因.-维恩地图,选择了网络工具的公共角色,基因.大学使用浓缩分析数据库(David)分析公共角色基因的基因功能注释(go),而京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析.公司使用字符串数据库建立蛋白质相互作用网络(PPI)。可视化PPI并通过Cytoscape软件筛选核心基因。结果共鉴定出25个共有基因。Go分析表明,这些共有基因主要集中在遗传信息的调控以及受体和信号的转导上。功能.KEGG分析表明,这些共同基因主要集中在甲状腺激素信号通路、催乳素信号通路、卵巢类固醇生成、MAPK信号通路和雌激素信号通路。通过string数据库和Cytoscape软件筛选出网络中连通性最强的六个基因:原癌基因(FOS)、糖皮质激素受体(NR3C1)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体(ESR2)、类固醇受体辅激活子(NCOA1)和前列腺素内过氧化物合酶2 (PTGS2)。结论FOS、NR3C1、EGFR、ESR2、NCOA1和PTGS2可能是EDC的共同因素,在EMS的发生发展中起重要作用,可能成为EMS早期诊断和治疗的生物标志物。