肉桂醛改善糖代谢作用靶点及生物信息学分析
作者:徐丽华; 刘银河; 钟篇; 张海林; 王丽丽; 钟泳滢; 赵洪磊
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目的利用数据挖掘技术构建一个组合网络,通过生物信息学分析获得改善肉桂醛葡萄糖代谢的目标。方法首先,使用网络药理学法在数据库中挖掘32条肉桂醛途径,以改善糖代谢。然后,基于R软件的“graphite”包,将数据库中的路径转换为生物网络,用于在线富集分析。然后,与Cytoscape一起建设代谢组学和网络药理学的联合网络。最后,推测了改善糖代谢的关键目标和潜在的相关机制。结果筛选出10个与肉桂醛改善糖代谢相关的关键靶点,其中IRS1号、AMPK1号、AMPK2号、PRKAB-1和PRKAB-2最有可能受到肉桂醛的调控。结论通过网络比较和比较建立生物路径组合网络的方法,对肉桂醛的候选关键目标进行分析是有效可行的。