CRISPR-Cas系统是一种细菌的适应性免疫系统，它参与对不同类型的移动遗传元素（如质粒、噬菌体、转座子等）的入侵进行特异性防御。分析肠球菌（Enterococcus）基因组中该系统的基因结构，并探讨其与细菌耐药基因的关系。从NCBI数据库下载了10种肠球菌物种的全基因组信息，并用软件对CRISPR-CAS系统的分布、cas1基因、重复序列和间隔序列进行了比较和分析。发现耐药相关基因，并分析其与CRISPR-Cas系统的关系。在肠球菌的235株菌株中，35株（14.9%）包含完整的CRISPR-cas系统，包括196个CRISPR阵列和46个cas基因簇阵列。肠球菌基因组中的CRISPR系统主要是II－A型（80.4%），其次是II－C型（15.2%）。cas1基因序列的系统发育分析结果与CRISPR-cas系统的分型基本一致。CRISPR-CAS系统在肠球菌的分布因菌株而异。CRISPR-CAS系统可能会阻碍一些耐药基因物种在肠球菌的水平转移。