基于生物信息学构建卵巢浆液性腺癌预后风险模型及潜在中药预测分析
目的:构建卵巢浆液性腺癌(OV)预后风险模型,筛选潜在的中医药核心预后基因。方法:数据来源于TCGA数据库。采用差异分析和单因素Cox回归分析筛选OV差异的预后。采用Kaplan-Meier(km)曲线P<0.05和受试者工作特性曲线(ROC)。AUC>0.7作为筛选条件,进一步关注OV核心差异的预后。采用多变量Cox回归构建卵巢浆液性腺癌核心差异预后基因风险评分系统。结合临床资料,建立了临床预测模型,并对预测模型进行了校正分析和DCA分析。采用cibersort反褶积法分析OV中24种免疫细胞的含量和比例。通过coremine、tcmsp、TCMIP数据库预测OV差异核心预后基因的潜力。结果:从TCGA数据库中获得346个DEGs、14个ov差异预后基因和7个ov核心差异预后基因。非配对t检验显示,FGF20、trpm3和Klk3在卵巢浆液性腺癌中低表达,saa2-saa4、adgrg5、epb41l1和dap1在卵巢浆液性腺癌Vegas表达中低表达。多元Cox回归分析表明,saa2-saa4、adgrg5、trpm3和dapl1可能是OV的独立预后基因(P<0.05)。由七个核心差异预后基因构建的风险评分系统可以显著区分生存率。低风险评分有生存预后,这是卵巢浆液性腺癌的一个危险因素。时间ROC表明,风险评分能更好地评估生存预后,5年预测能力最好。临床预测模型Nomoto能有效预测1年、3年和5年生存率。免疫浸润结果与24种免疫细胞有相关性。Coremine数据库预测了18种具有不同核心预后基因的潜在中药,如三七叶、三七花和地榆。大多数药物属于肝经,其疗效主要与补虚止血有关。结论:本研究筛选出OV核心差异预后基因,构建了OV预后风险评分系统,建立了临床预后模型Nomoto,分析了OV核心差异预后基因的免疫浸润情况,预测了治疗OV的潜在中医药,为中医药介入卵巢癌提供了新思路