HDAC抑制剂SB939抑制三阴性乳腺癌细胞相关基因芯片分析

作者:王宝祯; 凌珺; 陈静; 李涛
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目的通过基因芯片技术分析sb939抑制剂对三阴性乳腺癌细胞基因表达的影响。方法 将三株阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231接种到培养皿中进行培养。细胞贴壁后,将收集的细胞分为三个对照组C(C1~C3,未经sb939处理)和六个实验组t(低剂量组T1~T3,高剂量组T4~T6),分别加入不同浓度的sb939(0,40,60mol·L-1)进行处理24  h的RNA提取和纯化。然后,将细胞与基因芯片杂交,通过芯片图像分析,按照1.5倍差异的标准筛选差异表达基因。结果与对照组相比,高剂量HDAC抑制剂sb939治疗后,根据基因芯片获得的数据分析差异表达基因,其中19个基因表达上调1.5倍,92个基因表达下调1.5倍。通过GSEA分析,mir-501、mir-23a和mir-23b等miRNA在下调基因中显著富集,通过KEGG途径富集分析,下调的DEGs途径主要集中在上皮细胞的细菌侵袭途径、肌醇磷酸代谢、磷脂酰肌醇信号系统和ECM受体相互作用途径。结论基因芯片技术可以快速检测sb939抑制剂抑制有效地三阴性乳腺癌细胞后相关基因、miRNA基因表达水平和相关信号通路的变化,为精准治疗乳腺癌提供了依据。